Инкубационный период составляет от 15 до 40 дней, в среднем около 1 месяца. У 10% пациентов болезнь протекает в желтушной форме, остальные 90% больных сталкиваются с безжелтушным вариантом гепатита Е. В течении заболевания можно выделить три стадии:
1. Преджелтушный период. Чаще всего он проявляется болью в правом подреберье, диспепсическими расстройствами: нарушения стула, снижение аппетита, тошнота и рвота. Также возможен гриппоподобный вариант болезни, напоминающий классическую ОРВИ, и астеновегетативный вариант, при котором преобладает слабость, расстройства сна и снижение работоспособности. Симптоматика продолжается от 4 до 7 дней
2. Желтушный период. Если болезнь протекает в желтушной форме, спустя неделю признаки общей интоксикации и недомогания дополняются желтухой. У пациента наблюдается желтушное окрашивание кожи и слизистых оболочек, потемнение мочи, обесцвечивание кала. В отличие от вирусного гепатита А, при ВГЕ общее состояние пациента с появлением желтухи не улучшается. Длительность симптомов — около 2 недель.
3. Перевод выздоровления. У человека постепенно исчезают признаки интоксикации, нормализуется цвет кожи, моча светлеет, а кал приобретает обычную окраску. Также восстанавливаются биохимические показатели, указывавшие на воспалении печени.
У 1% людей с желтушной формой заболевания развивается фульминантный гепатит, который может стать причиной острой печеночной недостаточности и летального исхода. Такой гепатит Е представляет особую опасность для беременных женщин и рожениц в первую неделю после родов. Если пациентка заражается в третьем триместре беременности, около 20% случаев завершается преждевременными родами, мертворождением, смертью матери.